Protein–RNA interactions for Protein: O88532

Zfr, Zinc finger RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfrO88532 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ZfrO88532 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfrO88532 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfrO88532 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfrO88532 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfrO88532 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfrO88532 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfrO88532 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZfrO88532 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ZfrO88532 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfrO88532 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ZfrO88532 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfrO88532 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfrO88532 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfrO88532 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
ZfrO88532 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfrO88532 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfrO88532 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfrO88532 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZfrO88532 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ZfrO88532 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ZfrO88532 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZfrO88532 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZfrO88532 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZfrO88532 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZfrO88532 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZfrO88532 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZfrO88532 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZfrO88532 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZfrO88532 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZfrO88532 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZfrO88532 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZfrO88532 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZfrO88532 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZfrO88532 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms