Protein–RNA interactions for Protein: O88502

Pde8a, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8A, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8aO88502 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde8aO88502 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde8aO88502 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pde8aO88502 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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