Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nme6O88425 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nme6O88425 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nme6O88425 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms