Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ctnnal1O88327 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ctnnal1O88327 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms