Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SfnO70456 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SfnO70456 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SfnO70456 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SfnO70456 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SfnO70456 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SfnO70456 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SfnO70456 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SfnO70456 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SfnO70456 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SfnO70456 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SfnO70456 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SfnO70456 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SfnO70456 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SfnO70456 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SfnO70456 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SfnO70456 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SfnO70456 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SfnO70456 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SfnO70456 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SfnO70456 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SfnO70456 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SfnO70456 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SfnO70456 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SfnO70456 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SfnO70456 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms