Protein–RNA interactions for Protein: O70238

Rhox6, Homeobox protein PSX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox6O70238 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rhox6O70238 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rhox6O70238 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Rhox6O70238 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rhox6O70238 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rhox6O70238 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rhox6O70238 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rhox6O70238 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rhox6O70238 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rhox6O70238 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms