Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RngttO55236 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
RngttO55236 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RngttO55236 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
RngttO55236 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
RngttO55236 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RngttO55236 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RngttO55236 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RngttO55236 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RngttO55236 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RngttO55236 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RngttO55236 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RngttO55236 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RngttO55236 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RngttO55236 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RngttO55236 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RngttO55236 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RngttO55236 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RngttO55236 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RngttO55236 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RngttO55236 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RngttO55236 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RngttO55236 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RngttO55236 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RngttO55236 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RngttO55236 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RngttO55236 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RngttO55236 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RngttO55236 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RngttO55236 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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