Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copb2O55029 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copb2O55029 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Copb2O55029 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Copb2O55029 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms