Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Itgb3O54890 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Itgb3O54890 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms