Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RaxO35602 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RaxO35602 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RaxO35602 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RaxO35602 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RaxO35602 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RaxO35602 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RaxO35602 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RaxO35602 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RaxO35602 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms