Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Opn1mwO35599 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Opn1mwO35599 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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