Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ptch2O35595 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptch2O35595 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptch2O35595 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ptch2O35595 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptch2O35595 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ptch2O35595 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Ptch2O35595 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ptch2O35595 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Ptch2O35595 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Ptch2O35595 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptch2O35595 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptch2O35595 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptch2O35595 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptch2O35595 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptch2O35595 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptch2O35595 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ptch2O35595 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptch2O35595 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ptch2O35595 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptch2O35595 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptch2O35595 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptch2O35595 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptch2O35595 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptch2O35595 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ptch2O35595 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ptch2O35595 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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