Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Prrt1O35449 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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Prrt1O35449 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Prrt1O35449 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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