Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kpna3O35344 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Kpna3O35344 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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