Protein–RNA interactions for Protein: O09172

Gclm, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclmO09172 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GclmO09172 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GclmO09172 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GclmO09172 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GclmO09172 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GclmO09172 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GclmO09172 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GclmO09172 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GclmO09172 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GclmO09172 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GclmO09172 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GclmO09172 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GclmO09172 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GclmO09172 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GclmO09172 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GclmO09172 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GclmO09172 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GclmO09172 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GclmO09172 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GclmO09172 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GclmO09172 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GclmO09172 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GclmO09172 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GclmO09172 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GclmO09172 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GclmO09172 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GclmO09172 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GclmO09172 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GclmO09172 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GclmO09172 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GclmO09172 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GclmO09172 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GclmO09172 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GclmO09172 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GclmO09172 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GclmO09172 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GclmO09172 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GclmO09172 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GclmO09172 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GclmO09172 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GclmO09172 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms