Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Eftud2O08810 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Eftud2O08810 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms