Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ube3aO08759 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms