Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sec22bO08547 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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