Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna5O08543 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Efna5O08543 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms