Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm2056J3QQ02 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm2056J3QQ02 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms