Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm5294J3QP53 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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