Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Smim18J3QNP2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms