Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm3415J3QMS8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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