Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28051J3QMA2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28051J3QMA2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28051J3QMA2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28051J3QMA2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28051J3QMA2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm28051J3QMA2 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm28051J3QMA2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28051J3QMA2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28051J3QMA2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm28051J3QMA2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28051J3QMA2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm28051J3QMA2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm28051J3QMA2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm28051J3QMA2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm28051J3QMA2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm28051J3QMA2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm28051J3QMA2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28051J3QMA2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28051J3QMA2 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Gm28051J3QMA2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28051J3QMA2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28051J3QMA2 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28051J3QMA2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28051J3QMA2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28051J3QMA2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28051J3QMA2 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28051J3QMA2 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28051J3QMA2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28051J3QMA2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28051J3QMA2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28051J3QMA2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Gm28051J3QMA2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28051J3QMA2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28051J3QMA2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm28051J3QMA2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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