Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Taf4bG5E8Z2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Taf4bG5E8Z2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Taf4bG5E8Z2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Taf4bG5E8Z2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Taf4bG5E8Z2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Taf4bG5E8Z2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Taf4bG5E8Z2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Taf4bG5E8Z2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Taf4bG5E8Z2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Taf4bG5E8Z2 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Taf4bG5E8Z2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms