Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Vmn1r58G3X9U3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms