Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Srp72F8VQC1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Srp72F8VQC1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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