Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcdh9F8VPK8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pcdh9F8VPK8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms