Protein–RNA interactions for Protein: F7CD45

Gm8334, Predicted gene 8334, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8334F7CD45 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8334F7CD45 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8334F7CD45 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms