Protein–RNA interactions for Protein: F7BTS7

Gm5798, Predicted gene 5798, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5798F7BTS7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gm5798F7BTS7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms