Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm42421F6X8D5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms