Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Zfp988F6VKC7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Zfp988F6VKC7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Zfp988F6VKC7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Zfp988F6VKC7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Zfp988F6VKC7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Zfp988F6VKC7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Zfp988F6VKC7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Zfp988F6VKC7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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Zfp988F6VKC7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Zfp988F6VKC7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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