Protein–RNA interactions for Protein: F2Z472

Svs3a, Seminal vesicle secretory protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Svs3aF2Z472 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Svs3aF2Z472 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Svs3aF2Z472 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms