Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Taf4E9QAP7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms