Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Rdh16f1E9Q9P8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rdh16f1E9Q9P8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rdh16f1E9Q9P8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rdh16f1E9Q9P8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Rdh16f1E9Q9P8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Rdh16f1E9Q9P8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rdh16f1E9Q9P8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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