Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Urb2E9Q7L1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms