Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BC005561E9Q5E2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BC005561E9Q5E2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms