Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trip11E9Q512 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms