Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
ApobE9Q414 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
ApobE9Q414 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC8.82□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC8.82□□□□□ -1
ApobE9Q414 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
ApobE9Q414 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
ApobE9Q414 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC8.82□□□□□ -1
ApobE9Q414 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
ApobE9Q414 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
ApobE9Q414 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
ApobE9Q414 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
ApobE9Q414 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
ApobE9Q414 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
ApobE9Q414 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
ApobE9Q414 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
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ApobE9Q414 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
ApobE9Q414 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
ApobE9Q414 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
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