Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cfap46E9Q2C0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cfap46E9Q2C0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms