Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Myo5cE9Q1F5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myo5cE9Q1F5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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