Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vmn1r68E9Q0V3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms