Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph10bE9PYQ0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms