Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Gm5415E9PXF3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms