Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim30bE9PVL6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms