Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syde2E9PUP1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syde2E9PUP1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms