Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rdh8D3Z6W3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Rdh8D3Z6W3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rdh8D3Z6W3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rdh8D3Z6W3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rdh8D3Z6W3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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