Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5F7

Gm20521, Predicted gene 20521, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20521D3Z5F7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm20521D3Z5F7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms