Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim12cD3Z3L3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim12cD3Z3L3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms