Protein–RNA interactions for Protein: D3YUU6

Crnn, Cornulin, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrnnD3YUU6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrnnD3YUU6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrnnD3YUU6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CrnnD3YUU6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrnnD3YUU6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrnnD3YUU6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrnnD3YUU6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrnnD3YUU6 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrnnD3YUU6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrnnD3YUU6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrnnD3YUU6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CrnnD3YUU6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrnnD3YUU6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrnnD3YUU6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CrnnD3YUU6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CrnnD3YUU6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrnnD3YUU6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrnnD3YUU6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrnnD3YUU6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrnnD3YUU6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrnnD3YUU6 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CrnnD3YUU6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CrnnD3YUU6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms